Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hipk4Q3V016 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hipk4Q3V016 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hipk4Q3V016 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms