Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn13Q3UW68 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn13Q3UW68 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn13Q3UW68 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Capn13Q3UW68 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn13Q3UW68 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn13Q3UW68 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn13Q3UW68 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms