Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skap1Q3UUV5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skap1Q3UUV5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap1Q3UUV5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap1Q3UUV5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms