Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cdc42bpaQ3UU96 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdc42bpaQ3UU96 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cdc42bpaQ3UU96 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cdc42bpaQ3UU96 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms