Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28047Q3US59 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28047Q3US59 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28047Q3US59 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms