Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf48Q3US17 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf48Q3US17 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf48Q3US17 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms