Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrch2Q3UMG5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrch2Q3UMG5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch2Q3UMG5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch2Q3UMG5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms