Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsg1Q3UM18 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsg1Q3UM18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsg1Q3UM18 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsg1Q3UM18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms