Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc33Q3ULW6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc33Q3ULW6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc33Q3ULW6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc33Q3ULW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms