Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mccc2Q3ULD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mccc2Q3ULD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms