Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmdn3Q3UJU9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmdn3Q3UJU9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rmdn3Q3UJU9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms