Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc34Q3UI66 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc34Q3UI66 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc34Q3UI66 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms