Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Lmod2Q3UHZ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lmod2Q3UHZ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lmod2Q3UHZ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmod2Q3UHZ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmod2Q3UHZ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms