Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkx6-3Q3UHX8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx6-3Q3UHX8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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