Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenplQ3U3S3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenplQ3U3S3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms