Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ogfod1Q3U0K8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ogfod1Q3U0K8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ogfod1Q3U0K8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ogfod1Q3U0K8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ogfod1Q3U0K8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms