Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shcbp1lQ3TTP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shcbp1lQ3TTP0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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