Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam172aQ3TNH5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam172aQ3TNH5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam172aQ3TNH5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms