Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Trappc13Q3TIR1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc13Q3TIR1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc13Q3TIR1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms