Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2f1Q3THK3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2f1Q3THK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2f1Q3THK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2f1Q3THK3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms