Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hp1bp3Q3TEA8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hp1bp3Q3TEA8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hp1bp3Q3TEA8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hp1bp3Q3TEA8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.7 ms