Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms