Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Riiad1Q3KNY5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Riiad1Q3KNY5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Riiad1Q3KNY5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Riiad1Q3KNY5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms