Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdss1Q33DR2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdss1Q33DR2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdss1Q33DR2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdss1Q33DR2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms