Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHK6

Gsdmc2, Gasdermin-C2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc2Q2KHK6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gsdmc2Q2KHK6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gsdmc2Q2KHK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gsdmc2Q2KHK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gsdmc2Q2KHK6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gsdmc2Q2KHK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gsdmc2Q2KHK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gsdmc2Q2KHK6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gsdmc2Q2KHK6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gsdmc2Q2KHK6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gsdmc2Q2KHK6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gsdmc2Q2KHK6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gsdmc2Q2KHK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms