Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ptchd1Q14B62 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ptchd1Q14B62 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ptchd1Q14B62 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ptchd1Q14B62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms