Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Traf3ip1Q149C2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Traf3ip1Q149C2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms