Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Dusp27Q148W8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dusp27Q148W8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dusp27Q148W8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dusp27Q148W8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dusp27Q148W8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms