Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col19a1Q0VF58 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col19a1Q0VF58 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col19a1Q0VF58 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col19a1Q0VF58 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col19a1Q0VF58 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col19a1Q0VF58 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms