Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h18Q0P678 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zc3h18Q0P678 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zc3h18Q0P678 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h18Q0P678 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms