Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pate4Q09098 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pate4Q09098 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pate4Q09098 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms