Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q08AU9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q08AU9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q08AU9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q08AU9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q08AU9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q08AU9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q08AU9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q08AU9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q08AU9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q08AU9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q08AU9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q08AU9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q08AU9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q08AU9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q08AU9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q08AU9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q08AU9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q08AU9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q08AU9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q08AU9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q08AU9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q08AU9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q08AU9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q08AU9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q08AU9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q08AU9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q08AU9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q08AU9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q08AU9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q08AU9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q08AU9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q08AU9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q08AU9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q08AU9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q08AU9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q08AU9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q08AU9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q08AU9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q08AU9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q08AU9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q08AU9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q08AU9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q08AU9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q08AU9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q08AU9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q08AU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q08AU9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q08AU9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q08AU9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q08AU9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q08AU9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q08AU9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q08AU9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q08AU9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q08AU9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q08AU9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q08AU9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q08AU9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q08AU9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q08AU9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q08AU9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q08AU9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q08AU9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q08AU9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q08AU9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q08AU9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q08AU9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q08AU9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q08AU9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q08AU9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q08AU9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q08AU9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q08AU9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q08AU9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q08AU9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q08AU9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q08AU9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q08AU9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q08AU9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q08AU9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q08AU9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q08AU9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q08AU9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q08AU9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q08AU9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q08AU9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q08AU9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q08AU9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q08AU9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms