Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AmbpQ07456 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AmbpQ07456 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AmbpQ07456 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms