Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn3Q07409 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn3Q07409 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn3Q07409 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntn3Q07409 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn3Q07409 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn3Q07409 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn3Q07409 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms