Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdf3Q07104 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf3Q07104 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf3Q07104 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms