Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top1Q04750 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top1Q04750 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top1Q04750 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top1Q04750 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top1Q04750 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top1Q04750 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top1Q04750 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top1Q04750 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top1Q04750 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top1Q04750 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1Q04750 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1Q04750 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top1Q04750 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top1Q04750 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms