Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfdn6Q03958 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pfdn6Q03958 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms