Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IhhP97812 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IhhP97812 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IhhP97812 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IhhP97812 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IhhP97812 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IhhP97812 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IhhP97812 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IhhP97812 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IhhP97812 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IhhP97812 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IhhP97812 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IhhP97812 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IhhP97812 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IhhP97812 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IhhP97812 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IhhP97812 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IhhP97812 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IhhP97812 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IhhP97812 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IhhP97812 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IhhP97812 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IhhP97812 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IhhP97812 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IhhP97812 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IhhP97812 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IhhP97812 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IhhP97812 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IhhP97812 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IhhP97812 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IhhP97812 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IhhP97812 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IhhP97812 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IhhP97812 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IhhP97812 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IhhP97812 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IhhP97812 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IhhP97812 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IhhP97812 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IhhP97812 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IhhP97812 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IhhP97812 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IhhP97812 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IhhP97812 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IhhP97812 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IhhP97812 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IhhP97812 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IhhP97812 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IhhP97812 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IhhP97812 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IhhP97812 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IhhP97812 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IhhP97812 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IhhP97812 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IhhP97812 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IhhP97812 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IhhP97812 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IhhP97812 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IhhP97812 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IhhP97812 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IhhP97812 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IhhP97812 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IhhP97812 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IhhP97812 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IhhP97812 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IhhP97812 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IhhP97812 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IhhP97812 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IhhP97812 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IhhP97812 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IhhP97812 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IhhP97812 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IhhP97812 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IhhP97812 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IhhP97812 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IhhP97812 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IhhP97812 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IhhP97812 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IhhP97812 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IhhP97812 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IhhP97812 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IhhP97812 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IhhP97812 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IhhP97812 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IhhP97812 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IhhP97812 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IhhP97812 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IhhP97812 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IhhP97812 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IhhP97812 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IhhP97812 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IhhP97812 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IhhP97812 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IhhP97812 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IhhP97812 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IhhP97812 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IhhP97812 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IhhP97812 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IhhP97812 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IhhP97812 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.4 ms