Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Xrn1P97789 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Xrn1P97789 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Xrn1P97789 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Xrn1P97789 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Xrn1P97789 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Xrn1P97789 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Xrn1P97789 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Xrn1P97789 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Xrn1P97789 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Xrn1P97789 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Xrn1P97789 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Xrn1P97789 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Xrn1P97789 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms