Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps45P97390 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps45P97390 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps45P97390 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps45P97390 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps45P97390 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps45P97390 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps45P97390 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps45P97390 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps45P97390 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps45P97390 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps45P97390 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms