Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pkp1P97350 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkp1P97350 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkp1P97350 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp1P97350 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms