Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabpb2P81069 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gabpb2P81069 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gabpb2P81069 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabpb2P81069 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms