Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx3P81067 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx3P81067 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx3P81067 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx3P81067 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irx3P81067 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Irx3P81067 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx3P81067 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx3P81067 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Irx3P81067 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx3P81067 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx3P81067 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx3P81067 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx3P81067 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irx3P81067 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Irx3P81067 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Irx3P81067 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Irx3P81067 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Irx3P81067 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Irx3P81067 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Irx3P81067 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irx3P81067 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irx3P81067 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Irx3P81067 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Irx3P81067 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx3P81067 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Irx3P81067 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx3P81067 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms