Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cct4P80315 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cct4P80315 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cct4P80315 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cct4P80315 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cct4P80315 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct4P80315 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct4P80315 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cct4P80315 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cct4P80315 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cct4P80315 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cct4P80315 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cct4P80315 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cct4P80315 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cct4P80315 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cct4P80315 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cct4P80315 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cct4P80315 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cct4P80315 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms