Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a3r1P70441 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a3r1P70441 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc9a3r1P70441 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc9a3r1P70441 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a3r1P70441 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms