Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2bP62915 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2bP62915 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2bP62915 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms