Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga11P61622 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga11P61622 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga11P61622 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga11P61622 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga11P61622 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga11P61622 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga11P61622 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga11P61622 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga11P61622 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga11P61622 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga11P61622 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga11P61622 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga11P61622 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga11P61622 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga11P61622 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga11P61622 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga11P61622 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms