Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Depdc5P61460 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Depdc5P61460 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Depdc5P61460 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Depdc5P61460 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Depdc5P61460 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Depdc5P61460 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Depdc5P61460 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Depdc5P61460 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Depdc5P61460 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Depdc5P61460 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Depdc5P61460 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Depdc5P61460 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Depdc5P61460 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms