Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smg6P61406 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smg6P61406 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smg6P61406 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Smg6P61406 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smg6P61406 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smg6P61406 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smg6P61406 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smg6P61406 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smg6P61406 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Smg6P61406 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Smg6P61406 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms