Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d1P61080 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2d1P61080 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d1P61080 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms